Het Junior College is een zelfstandige onderbouwlocatie in Julianadorp voor alle niveaus (bb, kb, tl, havo en vwo/gymnasium). De leerlingen van bb, kb en tl stromen na leerjaar 2 door naar de locaties in Den Helder. De leerlingen van de havo en het vwo gaan na leerjaar 3 naar de locatie in Den Helder. Het team van het Junior College zorgt voor een goede begeleiding en aansluiting met de andere locaties. In het lesrooster van de locatie zijn talenturen opgenomen. Tijdens deze uren kan er gekozen worden uit verschillende onderdelen en bepaalt de leerling zelf waar hij tijd en energie in wil steken.

Tijdens maatwerkuren en tijdens EXH-uren (extra hulpuren) heeft de leerling op het Junior College de mogelijkheid om extra hulp te krijgen bij een bepaald vak of om buiten de lesuren om achterstanden weg te werken.
Er is veel aandacht voor sport en cultuur. De school beschikt over een mooie sporthal, Sport aan Zee 1. Het Junior College organiseert voor alle leerlingen diverse sporttoernooien en activiteiten, waaronder de Junior Run, een individuele hardloopwedstrijd over de hellingbaan in het Junior College.
De school is niet alleen voor leerlingen uit Julianadorp maar ook voor leerlingen uit de regio, zoals Anna Paulowna, Breezand, Wieringen, Callantsoog en ’t Zand. De locatie is gelegen aan de Akkerbouwstraat in Julianadorp en is via fietspaden veilig te bereiken. Voor leerlingen die het kanaal moeten oversteken maakt Scholen aan Zee het mogelijk om gratis gebruik te kunnen maken van het veerpontje Westeinde. Hiervoor krijg de leerling een speciaal pasje uitgereikt.